作为国家中医药管理局病毒性心肌炎诊疗方案协作组组长单位，徐惠梅教授带领团队制定了病毒性心肌炎的诊疗方案，经过徐惠梅教授认真梳理、严格把关，确定了病毒性心肌炎完整的诊疗流程及方案，2011年开始进行全国范围内的推广，也参与制定了胸痹心痛-慢性稳定性心绞痛、心律失常-室性早搏、心衰病-慢性心力衰竭、心胀病-扩心病等临床路径诊疗方案的制定及修改，并在全国范围内推广。